Neue Wege in der Amplikon-Sequenzierung

(Mynewsdesk) * Next-Generation Sequenzierung von PCR-Fragmenten bis zu 3 kb
* Hochempfindliche Analyse mit einer Genauigkeit von bis zu 99,5%
* Abdeckung ganzer Gene einschließlich der flankierenden Regionen
* Nachweis von Co-Variationen und sich wiederholenden Sequenzen

Konstanz, 16. Juli 2015 – GATC Biotech hat heute die Markteinführung von zwei neuen Produkten zur Analyse von PCR-Fragmenten von bis zu 3 kb bekanntgegeben. INVIEW Amplicon Ultra-deep und INVIEW Amplicon Ultra-long ermöglichen Wissenschaftlern die kosteneffiziente Hochdurchsatz-Sequenzierung spezifischer Zielregionen komplexer Genome. Die gezielte Sequenzierung ausgewählter Regionen wird unter anderem zur Analyse genetischer Variationen verwendet.

„Die von Pacific Biosciences SMRT® Sequenzierung erreichten ultra-langen Leselängen, bieten uns Forschern, neue Möglichkeiten Gene umfassender, d.h. einschließlich der flankierenden Regionen, zu charakterisieren“, sagte Dr. Tobias Paprotka, Leiter Forschung & Entwicklung bei GATC Biotech. „Da mehrere SNPs durch einen einzigen Read an einem Stück abgedeckt werden, können auch Co-Varianten entdeckt und quantifiziert werden.“

Die neuartige Flexibilität in der Länge ermöglicht die unvoreingenommene Charakterisierung von benachbarten SNPs, regulatorischen Sequenzen in den nicht translatierten Regionen, sowie anderer genetisch bedingten Charakteristika , welche in der Regel nicht durch kürzere PCR-Fragmente abgedeckt werden. Spezifische Anwendungen für das neue INVIEW Amplicon Ultra-long sind beispielsweise CRISPR Genome Editing, Transposon-Insertion Sequenzierung, Human-Leukozyten-Antigen (HLA) Typisierung oder die Zuordnung von Haplotypen.

INVIEW Amplicon Ultra-deep, zur Analyse von Fragmenten bis zu 570 bp, ist bestens zur Identifizierung von seltenen Mutationen in komplexen und heterogenen Proben geeignet.

Die parallele Bearbeitung von bis zu 96 Proben erlaubt die schnelle und effiziente Lieferung der Ergebnisse. Umständlich Klonierungsschritte werden durch die Verwendung von Next?Generation Sequenzierung überflüssig. Beide Produkte sind auch entsprechend dem akkreditierten Qualtitässtandard ISO 17025 verfügbar und somit für die diagnostische Anwendung zugelassen

Wie alle INVIEW Produkte bieten beide Dienste zuverlässige Lösungen aus einer Hand mit optimierten Arbeitsabläufen für DNA-Isolierung, PCR-Amplifikation, Library-Erstellung, Amplikon-Sequenzierung und BioIT Unterstützung. Mit erhöhter Effizienz und Zuverlässigkeit eröffnen die beiden neuesten GATC Sequencing Solutions neue Wege in der gezielten Sequenzierung von PCR-Fragmenten.

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GATC Biotech ist Europas führender Anbieter von Sequenzierdienstleistungen und Bioinformatik. Seit mehr als zwei Jahrzehnten entwickelt das Familienunternehmen innovative und komplette Lösungen rund um DNA- und RNA-Sequenzierung, inklusive der bioinformatischen Auswertung. Die Aufträge aus Industrie und akademischer Forschung reichen dabei von einzelnen DNA-Proben bis hin zu komplexen Genomprojekten. Bis heute hat GATC Biotech über 10 Millionen Proben sequenziert, darunter zehntausende Genome von Pflanzen, Bakterien und anderen Organismen sowie hunderte von menschlichen Genomen. 

Als zertifizierter Service Provider (Pacific Biosciences, Illumina), bietet GATC Biotech Sequenzierungen auf allenführenden Technologien in den unternehmenseigenen Laboren an. Das nach ISO 17025 akkreditierte Genome and Diagnostic Centre, mit Schwerpunkt auf der Next Generation Sequenzierung, befindet sich am Unternehmenshauptsitz in Konstanz. Die standardisierten Komplettlösungen der INVIEW Produktpalette decken alle Bereiche der Genomforschung ab, wie z.B. Mikrobiom- und Transkriptom-Sequenzierung oder epigenetische Forschungsansätze. Als logistische Drehscheibe bietet Köln den idealen Standort für das hauseigene Labor der Sanger Sequenzierung. Voll automatisierte Laborprozesse garantieren die Einhaltung neuester und hochmodernster Qualitätsstandards. 

Weiterführende Informationen finden Sie auf der Firmenwebseite www.gatc-biotech.com.

Kontakt
GATC Biotech AG
Dr. Helge Schnerr
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78467 Konstanz
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